Missing coverage evidence...
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TTAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATACC  >  minE/844336‑844397                                                              | ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGGAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:730726/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:2149162/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:708685/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:628458/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:616582/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:3258076/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:3210128/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:2813770/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:2599534/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:2390567/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1034656/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:2129930/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1967874/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1872302/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1656686/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1547516/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1405741/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1401461/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1246955/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1126055/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGGCAATAcc  <  1:2344579/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTAGGGTCAATAcc  <  1:712442/62‑1 (MQ=255) ttAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCACCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1148069/62‑1 (MQ=255)  tAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1937413/61‑1 (MQ=255)  tAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:1404366/61‑1 (MQ=255)                gATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATAcc  <  1:2614108/47‑1 (MQ=255)                                                              | TTAGCTTTGGTGCCAGATTTAACGGCAGCAAGGCTATTCAGCAGTTCGTTCGGGTCAATACC  >  minE/844336‑844397

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑