Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	861734	861735	2	55 [0]	[0] 16	trpE	component I of anthranilate synthase

CGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTG  >  minE/861672‑861733                                                              | cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:513153/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2501598/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2644290/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2721423/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2771735/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2799640/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2814171/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2863753/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2915979/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2988148/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:3098797/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:3104183/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:3158375/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:356448/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2471228/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:538130/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:570211/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:617299/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:620430/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:64179/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:660688/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:702188/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:72179/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:769273/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:790113/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:795010/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:863595/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1929540/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1040609/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1083984/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1087644/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1105951/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1160989/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1242510/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:127637/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1283664/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1289045/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1428772/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1480163/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1512332/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1952055/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:199159/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2021464/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2126647/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2219582/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2237742/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2347090/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2352118/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2377325/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2390134/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2461339/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:2465451/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGCAATGCGCAGCGCACTg  >  1:528614/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGACACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:1982113/1‑62 (MQ=255) cGTTGCCGGAAAGTGCCTCGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTg  >  1:103807/1‑62 (MQ=255)                                                              | CGTTGCCGGAAAGTGCCTGGATTGTGACAGTGTCACCTAAAGCTGTAATGCGCAGCGCACTG  >  minE/861672‑861733

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑