Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 862940 862971 32 64 [0] [0] 87 yciV conserved hypothetical protein

CGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGATT  >  minE/862879‑862939
                                                            |
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCTCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:796169/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCTCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:17664/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:3094909/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2305529/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2447493/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2615504/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2650524/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2664846/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2698459/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2727572/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2787775/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2808470/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2822161/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:288406/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2908249/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:299167/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:3058413/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1179465/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:3220320/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:351438/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:38677/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:516317/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:541143/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:603279/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:606500/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:684502/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:70286/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:758968/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:967404/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:982653/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:987206/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1639006/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:106660/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:121705/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1235074/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1244339/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1245480/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:133968/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1398418/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1441347/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1456217/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1500230/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1512647/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1525693/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1609491/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2121692/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1644858/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1680033/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1699282/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:171968/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1719704/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1745885/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1843940/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1873090/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1899137/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2035206/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:206633/61‑1 (MQ=255)
cGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2090088/61‑1 (MQ=255)
 gTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2886698/60‑1 (MQ=255)
 gTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2256086/60‑1 (MQ=255)
 gTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1228972/60‑1 (MQ=255)
  tACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1513379/59‑1 (MQ=255)
   aCCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTAAGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:2287520/58‑1 (MQ=255)
     ccAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGAtt  <  1:1400866/56‑1 (MQ=255)
                                                            |
CGTACCCAGCTGGCGGCCCTTGCGCGTCAGCATCATTTATGGGCATCACAAGGATCTGATT  >  minE/862879‑862939

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: