Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	957674	957675	2	88 [0]	[0] 42	pqqL	predicted peptidase

GCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCG  >  minE/957611‑957673                                                               | gCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCA‑GATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1873080/62‑1 (MQ=255)   tCCTTCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1133202/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCATGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1121706/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2957682/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2530641/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:37081/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:336446/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:329891/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:327364/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:3146152/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:314180/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:3129125/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:3046892/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:988681/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2847768/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2750101/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2741660/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2729978/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2712604/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2687039/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2671870/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2646272/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2580412/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:658839/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1120796/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:906915/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:897488/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:888481/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:838077/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:827558/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:776675/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:728240/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:725056/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:703959/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:401220/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:621704/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:620843/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:612934/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:612831/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:559093/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:5240/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:442891/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:427538/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:405157/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1526154/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1908738/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:249394/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1795633/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1793687/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1756542/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1655166/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1653719/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1644618/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:155542/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1543111/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1855419/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1497483/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1474593/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1398318/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1310943/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1257499/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1235646/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1235004/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:120947/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:118325/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:207870/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2211434/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2215380/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2266353/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2482247/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2271677/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:229493/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2331900/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2416074/61‑1 (MQ=255)   tCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:240370/61‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTTATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2423306/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2517495/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1951216/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:940230/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2420697/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1331987/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2353340/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2340118/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1614267/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:3021418/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:201154/60‑1 (MQ=255)    ccTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:1992719/60‑1 (MQ=255)         tCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCg  <  1:2487719/55‑1 (MQ=255)                                                               | GCTCCTGCTCAGTCCATGCTGCAGGATCGTCATATTGAATAAGACTATTTACAATAGTGTTCG  >  minE/957611‑957673

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑