Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 972509 972529 21 148 [0] [0] 8 lsrD AI2 transporter

Only 100 of 148 total aligned reads displayed.

TTGGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCT  >  minE/972447‑972508
                                                             |
ttgTGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTTCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:495034/62‑1 (MQ=255)
ttgGTCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1079895/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAATGTGGTGTGCCGATGGCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:338880/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:365128/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2626199/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:336748/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:3189370/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:3162511/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:3125308/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:3115916/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:3092156/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:3006200/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:299456/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2983241/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:296221/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2944142/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2935376/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2848891/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:275242/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2739818/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2713487/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2711585/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:266000/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2641413/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:973616/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:735050/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:10539/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:954524/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:94815/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:859165/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:858260/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:839591/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:838920/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:811691/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:803055/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:781673/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:747121/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:372051/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:686863/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:644517/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:594932/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:568728/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:556356/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:501184/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:466036/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:449486/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:440553/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:400421/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1513111/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1871920/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1862472/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2583048/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:18386/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1816076/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:173409/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:170259/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1677233/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1610103/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1585292/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1562291/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1845237/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1478724/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1448624/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1446591/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1437945/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1414915/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:13820/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1352953/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1297053/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1284989/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1210347/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1112450/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1912622/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2562455/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2509957/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2481362/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2426762/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2378377/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2365389/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2262464/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2240565/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2223052/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2209550/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1879497/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2064747/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:212573/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2137203/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2179563/62‑1 (MQ=255)
ttgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGGGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2354751/62‑1 (MQ=255)
 tgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1721093/61‑1 (MQ=255)
 tgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2110128/61‑1 (MQ=255)
 tgGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:930914/61‑1 (MQ=255)
          tGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCTATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1555101/52‑1 (MQ=255)
           gTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2981067/51‑1 (MQ=255)
             ttCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:1235831/49‑1 (MQ=255)
                  aGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:407464/44‑1 (MQ=255)
                     ggtgTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2878587/41‑1 (MQ=255)
                         tgCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2038283/37‑1 (MQ=255)
                           ccGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:3044754/35‑1 (MQ=255)
                           ccGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCt  <  1:2962214/35‑1 (MQ=255)
                                                             |
TTGGGCGTACTGTTTCAAAGTGGTGTGCCGATGCCGCTGGCGATACTCCTGACCTTACTGCT  >  minE/972447‑972508

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: