Missing coverage evidence...
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GCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGC  >  minE/991870‑991930                                                             | gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:2254041/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:968848/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:76765/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:687398/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:562529/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:46680/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:458425/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:345513/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:2865765/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:2538767/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:2498197/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:1019961/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:219071/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:2182533/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:2148876/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:2066478/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:1606159/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:1562989/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:1468501/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:1372512/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:1318775/1‑61 (MQ=255) gCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGc  >  1:106957/1‑61 (MQ=255)                                                             | GCTTGTGCCGGGGTGATTGTGCTGCAAGGTTTGTCTCTGGCGTCTATTCACTCATCCGTGC  >  minE/991870‑991930

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑