Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	993912	993923	12	47 [0]	[0] 10	clcB	predicted voltage‑gated chloride channel

ATAGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTC  >  minE/993850‑993911                                                              | ataGCACCGTACAATGCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2696080/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGTATCTTc  <  1:217495/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2993159/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2231274/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2282196/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2375766/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2403313/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2464846/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2584659/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2685946/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:296923/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2984801/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2180453/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:3160798/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:3178814/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:3229654/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:336261/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:549160/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:587739/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:707883/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:758525/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:89515/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:917158/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:976087/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1805665/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1087092/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1118706/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1146775/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:124465/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1330530/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1494423/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1545489/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1598046/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1605100/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1665024/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1731682/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2225219/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1835305/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1865990/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1989411/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2051508/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:21155/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2129029/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:2148441/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1058046/62‑1 (MQ=255) ataGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGCTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1807070/62‑1 (MQ=255)             aaTCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTc  <  1:1945999/50‑1 (MQ=255)                                                              | ATAGCACCGTACAATCCTTTTTAACCGCCCCACCACTGTTAATGATCATTGCCGGGATCTTC  >  minE/993850‑993911

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑