Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1010979	1011007	29	24 [0]	[0] 23	rstB	sensory histidine kinase in two‑component regulatory system with RstA

CAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAT  >  minE/1010917‑1010978                                                              | cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCTTCAGATGCGAt  <  1:50856/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:2926893/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:921555/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:776952/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:758911/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:674981/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:591845/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:387584/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:386753/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:374589/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:3075362/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:1194370/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:2681912/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:251697/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:2484134/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:2440612/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:2426944/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:202721/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:1658402/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:1274097/62‑1 (MQ=255) cAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTATTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCCAt  <  1:1227945/62‑1 (MQ=255)  aGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:1622637/61‑1 (MQ=255)  aGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:823946/61‑1 (MQ=255)            tGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAt  <  1:1739043/51‑1 (MQ=255)                                                              | CAGCCACTACGTGCTGGCAGTTGGTCCTGTTCCTTATCTTTATTATCTCCATCAGATGCGAT  >  minE/1010917‑1010978

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑