Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1016950 1017033 84 59 [0] [0] 6 manA mannose‑6‑phosphate isomerase

AGCCAGCAGGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAG  >  minE/1016888‑1016949
                                                             |
aGCCAGCAGGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2643777/62‑1 (MQ=255)
aGCCAGCAGGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1715897/62‑1 (MQ=255)
aGCCAGCAGGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2816961/62‑1 (MQ=255)
aGCCAGCAGGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2912056/62‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2875882/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2337806/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2435956/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2544965/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2642246/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2645979/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2683636/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2721405/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2728098/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2793400/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2820651/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1048807/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2978233/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:3183889/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:392183/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:495719/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:495982/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:59929/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:636736/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:796582/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:832719/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:858905/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:93792/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:953806/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1622302/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1121038/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1272839/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1317651/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1369732/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1415541/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1061093/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1458158/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1491993/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:153365/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2309257/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1607868/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1650318/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1050958/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1751696/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:180407/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:188574/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1954901/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:202737/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2182313/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2194211/59‑1 (MQ=255)
   cagcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1008582/59‑1 (MQ=255)
    agcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2727877/58‑1 (MQ=255)
    agcagGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:73470/58‑1 (MQ=255)
        gggTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2947174/54‑1 (MQ=255)
             aaCCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1549029/49‑1 (MQ=255)
             aaCCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:882867/49‑1 (MQ=255)
              aCCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1677607/48‑1 (MQ=255)
              aCCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:2348511/48‑1 (MQ=255)
               ccGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:142643/47‑1 (MQ=255)
                          gATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAg  <  1:1693787/36‑1 (MQ=255)
                                                             |
AGCCAGCAGGGTGAACCGTGGCAAACGATTCGTTTAATTTCTGAATTTTACCCGGAAGACAG  >  minE/1016888‑1016949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: