Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1017877	1017922	46	4 [0]	[0] 5	ydgA	conserved hypothetical protein

CTTCAACGAATCGGTTGATCATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGA  >  minE/1017815‑1017876                                                              | cTTCAACGAATCGGTTGATCATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGa  <  1:10196/62‑1 (MQ=255) cTTCAACGAATCGGTTGATCATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGa  <  1:1443744/62‑1 (MQ=255) cTTCAACGAATCGGTTGATCATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGa  <  1:2077528/62‑1 (MQ=255) cTTCAACGAATCGGTTGATCATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGa  <  1:2468132/62‑1 (MQ=255)                                                              | CTTCAACGAATCGGTTGATCATGGTCCCTTCCCGCTTGCCCAGCTTAAAAAACTGAACCTGA  >  minE/1017815‑1017876

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑