Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1040608	1040619	12	76 [0]	[0] 38	ydgR	predicted transporter

GTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTA  >  minE/1040549‑1040607                                                           | gTTATGGGATCGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1020567/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTAGCTGGTTa  >  1:846195/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:467050/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:262105/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:383700/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:366457/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:3146400/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:3139784/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:3072041/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:3036435/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:3030918/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:3015093/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:299198/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2972245/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2958338/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2906955/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2845330/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2710155/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2650628/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:997243/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:743371/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1000457/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:969671/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:945851/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:931416/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:888713/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:88011/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:802430/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:764386/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:468268/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:732438/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:681429/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:655832/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:644539/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:609432/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:594740/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:563035/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:55183/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1634672/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2603086/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1967089/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:189779/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1874616/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1811305/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1770127/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1701095/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:164303/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:164146/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2026123/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1623387/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1485663/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1439750/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1433867/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1363960/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1238739/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1125864/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:1096403/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2235112/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2495575/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2465295/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2426305/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2359806/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2320413/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2293774/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:225262/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2076204/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2192126/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2142705/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2127884/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2122018/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2101756/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2083353/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTa  >  1:2079732/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGCTTa  >  1:2741548/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACATGGTTa  >  1:693989/1‑59 (MQ=255) gTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCGGTTTACCTGGTTa  >  1:2426714/1‑59 (MQ=255)                                                           | GTTATGGGAACGTTTTGGTTATTACGGCCTACAAGGAATTATGGCTGTTTACCTGGTTA  >  minE/1040549‑1040607

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑