Missing coverage evidence...
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GTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGTAT  >  minE/1055134‑1055195                                                              | gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:457435/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2342746/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2544568/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2614370/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2776856/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2883343/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2958723/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2989331/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:3021152/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:3188998/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:3191944/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2264028/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:582564/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:600405/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:640442/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:678380/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:695822/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:748754/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:803685/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:850030/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:881859/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:946941/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1468838/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:116751/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:119352/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1205067/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1256776/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1268049/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1271896/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1301197/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:136469/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1378290/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1423639/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:107358/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1478433/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1542870/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1565850/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:157419/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1582271/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1744131/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:178322/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:1919858/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:2117995/1‑62 (MQ=255) gTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGtat  >  1:215346/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTAAACGCGGCATTGCTTATCTGCATATGTCAGAACCAGATTGGGCGGGGGGTGAACCGTAT  >  minE/1055134‑1055195

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑