Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1076206	1076321	116	24 [0]	[0] 49	ydhS	conserved hypothetical protein with FAD/NAD(P)‑binding domain

GCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAT  >  minE/1076145‑1076205                                                             | gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:254669/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:984868/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:90670/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:885271/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:612053/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:34304/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:3074293/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:3021197/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:3014003/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:2687984/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:2593247/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1309017/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:2357448/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:2196777/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:2188578/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:2135614/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:2061542/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:2006663/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1954001/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1860970/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:164832/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1462263/61‑1 (MQ=255) gCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:1402963/61‑1 (MQ=255)    cgcgGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAt  <  1:715841/58‑1 (MQ=255)                                                             | GCCCGCGGACAACGTCCGCTTAAAGTGAAAGATATCCCTTTCCCTGGGCTACGCGAGCAAT  >  minE/1076145‑1076205

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑