Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1118965	1118989	25	24 [0]	[0] 16	ydiU/ydiV	conserved hypothetical protein/conserved hypothetical protein

ATCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGT  >  minE/1118903‑1118964                                                              | aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:2055262/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:9394/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:788006/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:729444/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:646876/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:3208374/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:292373/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:2881787/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:272138/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:2610096/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:2330800/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:2227670/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1021182/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1998160/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1809648/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1799309/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1621927/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1595944/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1579004/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1523625/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1516622/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1432834/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1347105/1‑62 (MQ=255) aTCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGt  >  1:1049413/1‑62 (MQ=255)                                                              | ATCGCGCCAGCGGGTAACAAAAGACAGGGTCATAGATCCTCCTGTTTGATAGTGTAGACGGT  >  minE/1118903‑1118964

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑