Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1125675	1125687	13	28 [0]	[0] 8	pheS	phenylalanine tRNA synthetase, alpha subunit

CACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGC  >  minE/1125623‑1125674                                                    | cACTGATTTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2960707/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCGTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:1858343/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2821945/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:90438/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:875103/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:828896/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:8192/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:56492/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:508139/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:3197196/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:3130121/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:3113011/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2969770/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2925603/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2920241/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:1053353/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2790778/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2786587/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2732082/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:2123291/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:1769973/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:146175/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:1418636/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:1379098/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:1316701/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:1199502/52‑1 (MQ=255) cACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:1173117/52‑1 (MQ=255)     gAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGc  <  1:206184/48‑1 (MQ=255)                                                    | CACTGAATTTCATAATCTATTCCTGCCTTATTTAAACTGTTTGAGGAAACGC  >  minE/1125623‑1125674

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑