Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1146514	1146518	5	15 [0]	[0] 38	chbR	DNA‑binding transcriptional dual regulator

AAAATTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGTCG  >  minE/1146452‑1146513                                                              | aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:1259030/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:1595207/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:164166/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:2024374/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:216061/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:2177299/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:2227019/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:2399813/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:2462776/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:2595292/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:2834674/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:713817/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:855224/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:870407/1‑62 (MQ=255) aaaaTTAATACGGATTTCATTAATAATATGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGtcg  >  1:2818278/1‑62 (MQ=255)                                                              | AAAATTAATACGGATTTCATTAATAATCTGCATTGGCGTTTTGCCATAATATCGTTGAGTCG  >  minE/1146452‑1146513

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑