Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1148176 1148211 36 25 [0] [0] 9 chbC N,N'‑diacetylchitobiose‑specific enzyme IIC component of PTS

CGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCAGA  >  minE/1148114‑1148175
                                                             |
cggcATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:3068967/59‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:906949/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:824818/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:573912/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:478150/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:419393/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:400067/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:3241320/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:3228144/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:3209569/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:3093709/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:3087681/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:2971186/62‑1 (MQ=255)
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cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:185547/62‑1 (MQ=255)
cGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:1079119/62‑1 (MQ=255)
 gTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:2625511/61‑1 (MQ=255)
 gTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:252359/61‑1 (MQ=255)
 gTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:1051661/61‑1 (MQ=255)
     tAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCaga  <  1:42207/57‑1 (MQ=255)
                                                             |
CGTCATAATGCCGTTGTCCAGTGCGGTCAGCGCCAGCGCGCCATGAATACCGAAGAACCAGA  >  minE/1148114‑1148175

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: