Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1151268	1151269	2	58 [0]	[0] 39	ydjQ	endonuclease of nucleotide excision repair

TGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATCC  >  minE/1151207‑1151267                                                             | tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:3139019/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:243509/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:244519/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2487465/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2509539/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2541674/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2550405/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2595904/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2643732/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2794332/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2798344/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2923434/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2929824/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:294567/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:308467/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2307801/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:3150790/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:319176/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:3198931/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:3204387/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:3229212/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:405592/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:456509/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:546268/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:617227/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:774729/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:818993/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:852967/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:903604/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1794136/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1106676/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1109065/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1154114/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:126511/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:132001/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1366113/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:139903/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1414825/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1432455/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1449986/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1496709/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1525273/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1553940/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1704398/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1051423/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1838040/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1859836/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1894197/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1918357/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1952736/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2072681/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2090192/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:209430/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2261877/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2266286/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2277344/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:2297869/1‑61 (MQ=255) tGGTACGGCGTTTAACTTATCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATcc  >  1:1887641/1‑61 (MQ=255)                                                             | TGGTACGGCGTTTAACTTCTCCGCGGCTCGAATTTGAAGCTGCGGCAATTTATGAATATCC  >  minE/1151207‑1151267

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑