Missing coverage evidence...
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CAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGC  >  minE/1151431‑1151492                                                              | cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:323305/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1019443/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2556283/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2676200/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2819436/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:285820/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2876248/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2928284/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:297057/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3044266/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3089065/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3104248/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:320179/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2510245/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:3240194/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:378172/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:464648/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:548340/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:599638/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:69670/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:742668/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:785131/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:856882/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:918426/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:946692/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1837828/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1139700/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1178527/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1256566/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1267120/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:12905/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1307713/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1601799/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1603704/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1621079/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1733927/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1814416/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:250158/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1890475/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1977305/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1981066/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2062716/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2138080/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2365281/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2428294/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2435094/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2436272/62‑1 (MQ=255) cAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:2486180/62‑1 (MQ=255)  aaTCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:1871792/61‑1 (MQ=255)  aaTCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:680725/61‑1 (MQ=255)  aaTCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAgc  <  1:255224/61‑1 (MQ=255)                                                              | CAATCCCGACGGATCAGCTGGATATGTACCGCCGGTGAAATCGGCGCTCTGCTCCTTGAAGC  >  minE/1151431‑1151492

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑