Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1156023	1156066	44	56 [0]	[0] 65	astD	succinylglutamic semialdehyde dehydrogenase

CATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGG  >  minE/1155961‑1156022                                                              | cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:368561/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2757073/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2804426/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2817661/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2843793/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2862195/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:29573/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:3005402/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:3039322/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:3039823/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:3057895/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:3175723/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:3285321/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:3295450/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2626807/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:369724/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:464715/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:550669/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:557713/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:573167/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:576894/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:705372/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:717811/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:925687/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:942412/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:942562/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:968445/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:971862/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1679545/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1201197/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:121458/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1238540/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1268200/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1315351/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:13311/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1417183/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1437963/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1465973/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1499895/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1516217/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1524875/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1667227/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1142286/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1728658/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1785700/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1879829/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1882035/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2017663/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2300151/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2338439/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2400803/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2430390/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2497253/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2506103/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:2554377/1‑62 (MQ=255) cATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGAGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAgg  >  1:1758982/1‑62 (MQ=255)                                                              | CATCGGAAAAATCCAGCCCGGGGTTAAGCGTGGCGGGCAATGTTAACGAGTCCGACTCCAGG  >  minE/1155961‑1156022

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑