Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1159616	1159634	19	57 [0]	[0] 8	astC	succinylornithine transaminase, PLP‑dependent

CTCTTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCG  >  minE/1159554‑1159615                                                              | ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:324599/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2397616/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2552095/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2575407/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2590611/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:268462/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2705191/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2765534/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2772583/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2785340/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:280293/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2942530/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:3006086/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1186278/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:345745/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:346802/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:349655/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:367223/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:424042/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:466863/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:624460/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:699901/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:705371/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:829801/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:89711/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:926780/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1852493/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1013026/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1251662/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1253164/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1300043/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1308867/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1379521/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1404917/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1410965/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1566683/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1755205/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:18430/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2316632/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2311754/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1944472/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:225747/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1957124/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1958842/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1977328/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2033680/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2150362/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1933980/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:22319/62‑1 (MQ=255) ctctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2200072/62‑1 (MQ=255)  tctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:424733/61‑1 (MQ=255)  tctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2591806/61‑1 (MQ=255)  tctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:3266425/61‑1 (MQ=255)  tctTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:191023/61‑1 (MQ=255)         ccTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:2518312/54‑1 (MQ=255)                  cccACAAGCGCGAAGCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:1403426/45‑1 (MQ=255)                            cgAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCg  <  1:638060/35‑1 (MQ=255)                                                              | CTCTTTCCCCTGCTGATCCCACAAGCGCGAACCTTCGCCACGTACCGGTATAAAGGGTGCCG  >  minE/1159554‑1159615

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑