Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1167148	1167177	30	77 [0]	[0] 2	[ynjE]	[ynjE]

ATAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTC  >  minE/1167088‑1167147                                                            | aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGTACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3136101/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTTAAAACTACAATGTc  <  1:2650643/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3031318/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3066536/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3019034/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:297644/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2976157/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2911221/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:268665/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2669280/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2654811/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2579120/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2544653/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2496959/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2406412/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2396026/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2385162/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:228681/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2228588/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:516276/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:842206/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:787626/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:782778/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:748298/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:716204/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:714956/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:623566/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:595311/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1107766/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:415583/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3220858/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3196532/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3188860/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:314398/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3136155/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3085617/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1883072/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1381003/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:132842/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1302826/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1484951/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1500591/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1268626/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1247382/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:155199/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1565269/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:16018/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1216885/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1680910/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1756733/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1784144/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1886983/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1887849/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1958544/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:205259/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2053041/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2076069/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2088411/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1180415/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2139756/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:214347/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1068909/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2170422/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2188419/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2222880/60‑1 (MQ=255) aTAACGCAAAGTTTTTCTAAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1276580/60‑1 (MQ=255)  tAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:868953/59‑1 (MQ=255)  tAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:454710/59‑1 (MQ=255)  tAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:335357/59‑1 (MQ=255)  tAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:3243473/59‑1 (MQ=255)  tAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:154665/59‑1 (MQ=255)  tAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:165762/59‑1 (MQ=255)  tAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2163304/59‑1 (MQ=255)    aCGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1455853/57‑1 (MQ=255)       cAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2528221/54‑1 (MQ=255)              tttCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:1503707/47‑1 (MQ=255)                        cGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTc  <  1:2201726/37‑1 (MQ=255)                                                            | ATAACGCAAAGTTTTTCTCAATGCGTCAGTTCAGAATGGCGCACTCAAAACTACAATGTC  >  minE/1167088‑1167147

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑