Missing coverage evidence...
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GTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCA  >  minE/1168007‑1168068                                                              | gTGAAGATCCCGGCACAACCGGAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2341031/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTTCa  <  1:2952814/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:3280930/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2442019/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2566041/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2689094/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2724298/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2820992/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2882148/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2883441/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2896951/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1123469/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:3285311/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:33668/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:406181/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:450371/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:571560/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:614439/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:712522/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:828809/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:919006/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2060409/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1158634/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1174537/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1214578/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1415717/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1449588/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1449778/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1048447/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1619211/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2407563/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2095959/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2184447/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2226652/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2229398/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2287708/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2327619/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2365076/62‑1 (MQ=255) gTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:2394218/62‑1 (MQ=255)  tGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:1852080/61‑1 (MQ=255)    aaGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:159977/59‑1 (MQ=255)            ggCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCa  <  1:944425/51‑1 (MQ=255)                                                              | GTGAAGATCCCGGCACAACCGCAGTTGATGCTCGATATGGAACAGGCCCGTGGACTGCTGCA  >  minE/1168007‑1168068

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑