Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	86853	86908	56	54 [0]	[0] 38	murC	UDP‑N‑acetylmuramate:L‑alanine ligase

TCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGC  >  minE/86791‑86852                                                              | tCGTGGCCGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2047284/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2682013/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2640738/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2882749/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:297141/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2971720/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2991069/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:3091189/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:362814/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:418423/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:511984/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:515505/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:561541/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:622973/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:624297/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:659824/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:66219/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:677048/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:704033/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:745843/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:786346/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:795742/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:849676/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:872907/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:965703/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:974982/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2052892/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1324659/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1338505/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1375808/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:149464/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1525614/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1762402/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1823892/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1922695/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2006869/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2135294/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2137314/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2205222/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2374367/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2535894/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2570981/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCAGAGATGc  <  1:2347154/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGAGCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:3195352/62‑1 (MQ=255) tCGTGGACGAGGGAAAAATGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:659825/62‑1 (MQ=255)         gTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1524451/54‑1 (MQ=255)         gTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1447369/54‑1 (MQ=255)                 aTTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2517070/46‑1 (MQ=255)                 aTTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:1111479/46‑1 (MQ=255)                    gATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2440184/43‑1 (MQ=255)                      tCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2588012/41‑1 (MQ=255)                       cccATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:2296255/40‑1 (MQ=255)                           ttCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGc  <  1:175976/36‑1 (MQ=255)                            tCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCTAGATGc  <  1:2638734/35‑1 (MQ=255)                                                              | TCGTGGACGTGGGAAAATTGATCCCATTCTGGTGCCGGATCCGGCGCGGGTAGCCGAGATGC  >  minE/86791‑86852

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑