Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1176719	1176728	10	17 [0]	[0] 12	sppA	protease IV

CAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTC  >  minE/1176657‑1176718                                                              | cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:2875983/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:798241/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:751080/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:499908/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:415038/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:3222787/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:3144123/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:3083836/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:3028717/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:1188630/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:2793844/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:2757404/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:2689476/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:1856609/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:1834652/62‑1 (MQ=255) cAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:147765/62‑1 (MQ=255)  aGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTc  <  1:196619/61‑1 (MQ=255)                                                              | CAGGTCAGTGGTGGTGATTCGAAAGAAACGGCCAGTCGTGGCGCACTGCTGCTGGACATTTC  >  minE/1176657‑1176718

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑