Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1177146	1177159	14	13 [0]	[0] 22	sppA	protease IV

GTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGT  >  minE/1177084‑1177145                                                              | gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:1312797/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:149160/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:1605752/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:2000764/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:2472255/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:2500221/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:2505843/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:2587649/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:2632660/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:660647/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:695442/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:900015/1‑62 (MQ=255) gTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGt  >  1:907131/1‑62 (MQ=255)                                                              | GTCTGTACTACAAATCGTTGCTGGATAAGCTGAAAGTTTCCACCCATGTGTTCCGCGTGGGT  >  minE/1177084‑1177145

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑