Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1177631	1177641	11	31 [0]	[0] 55	sppA	protease IV

GGCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAT  >  minE/1177569‑1177630                                                              | ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCTACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:1246539/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2480088/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:708722/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:696843/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:681894/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:526771/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:367701/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:3078719/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:3065740/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:3065452/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:3060798/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2968984/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2872422/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2506390/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:1133947/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2471468/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2360165/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:235078/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:228710/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2183709/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2176145/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:197352/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:1883086/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:1625522/62‑1 (MQ=255) ggCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:1478216/62‑1 (MQ=255)  gCGGTGATACCACTGCGTCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:2336043/61‑1 (MQ=255)  gCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:261641/61‑1 (MQ=255)  gCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:3072393/61‑1 (MQ=255)     gTGATACCACTGCGGCAGAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:874902/58‑1 (MQ=255)       gATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:17390/56‑1 (MQ=255)                  ggCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAt  <  1:194238/45‑1 (MQ=255)                                                              | GGCGGTGATACCACTGCGGCACAAATCCGCGACGCTCGCCTTGACCCGAAAGTGAAAGCGAT  >  minE/1177569‑1177630

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑