Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1177965	1177969	5	76 [0]	[0] 51	sppA	protease IV

GCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTA  >  minE/1177904‑1177964                                                             | gCTGGCGGATGTTTTTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:222158/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCGCCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2276445/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2624761/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2893549/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2893090/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2845095/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:282221/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2818999/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2781557/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2770334/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2712785/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2703691/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:3155670/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2624360/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2567537/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2546538/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2429053/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2425542/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2412/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2369320/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:60518/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:917491/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:759660/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:733758/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:733202/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:714654/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:714106/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:710311/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:670930/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:66635/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2367105/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:601073/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:555810/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:533213/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:44216/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:3254051/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:3251961/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:3193261/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:3175795/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1356045/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1696128/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1680129/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1656815/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1605377/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1557644/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1473153/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1436739/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1436029/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1399053/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1738750/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1325722/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1287674/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1268870/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1266645/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1202074/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1046940/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1025396/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:10115/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1972461/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:233227/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2282069/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2251253/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2178405/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2159789/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2097626/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2077265/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:202461/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:100998/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1955278/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1895039/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1887165/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1832066/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1823668/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1761191/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACGGCCGGCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:2988437/1‑61 (MQ=255) gCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGCGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTa  >  1:1914650/1‑61 (MQ=255)                                                             | GCTGGCGGATGTTTCTATCACCAGGGCACTGCCGCCGGAAGCGCAGCTGATGATGCAGTTA  >  minE/1177904‑1177964

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑