Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1178175	1178266	92	88 [0]	[0] 3	sppA	protease IV

GCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATAT  >  minE/1178136‑1178174                                       | gcagTGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1999275/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3052943/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:402068/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:355184/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3263473/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3250643/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3165941/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3123165/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3122332/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3119618/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3097231/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:3068331/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:434010/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2984056/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2978359/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2907900/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2872141/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2868212/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2832199/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2682743/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2664431/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2622959/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2516479/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:740829/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:954284/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:884681/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:85646/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:81854/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:799777/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:784087/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:759092/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:747046/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:746688/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:743911/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2432080/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:729382/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:63370/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:613442/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:595734/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:559603/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:536123/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:524016/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:496865/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:453361/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:451676/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1428829/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1692893/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1672752/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1645650/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1635574/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1618612/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:152547/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1510249/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1498949/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1438929/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1434124/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1701364/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1406836/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1369024/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1360333/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:129111/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1283495/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1239283/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1153457/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1140696/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1097481/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1078767/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2109715/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2405307/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2345101/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:231836/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2283232/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2275414/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2269127/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2194726/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2152026/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2148139/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2128076/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1057669/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2098686/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2094958/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2090211/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:2035473/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1921453/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1848093/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1778967/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAatat  >  1:1777418/1‑39 (MQ=255) gcagAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATATGGAatat  >  1:1786400/1‑39 (MQ=255)                                       | GCAGAGCTGGCAAAAGTGAAACAGTGGCATCTGGAATAT  >  minE/1178136‑1178174

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑