Missing coverage evidence...
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ACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGT  >  minE/1190096‑1190157                                                              | aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:1285118/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:1660315/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:1976074/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:2480995/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:2544610/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:3226195/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:469336/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:662709/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:915509/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:947311/1‑62 (MQ=255) aCGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGt  >  1:983947/1‑62 (MQ=255)                                                              | ACGTCTTCGTGGAAAAGCGTTCTGTTCTGGATTTTGACGGCGTTAATTTTGCTGAATATGGT  >  minE/1190096‑1190157

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑