Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1191436	1191472	37	18 [0]	[0] 135	yeaJ/rnd	predicted diguanylate cyclase/ribonuclease D

CGCAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAT  >  minE/1191374‑1191435                                                              | cgcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:177370/1‑62 (MQ=255) cgcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2240017/1‑62 (MQ=255) cgcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:445072/1‑62 (MQ=255) cgcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:317879/1‑62 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:765978/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:1644597/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:528139/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:523297/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:3128493/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2750846/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2621046/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2501789/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2391694/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2383862/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2350842/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2295601/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2215495/1‑61 (MQ=255)  gcAGGTAGCCAACCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAt  >  1:2654307/1‑61 (MQ=255)                                                              | CGCAGGTAGCCAGCCGGAGGCCTCCGTTTCTACCATAAGCTTGGCGGTGATCGGTAACAGAT  >  minE/1191374‑1191435

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑