Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1207570	1207582	13	14 [0]	[0] 38	manY	mannose‑specific enzyme IIC component of PTS

CTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGT  >  minE/1207508‑1207569                                                              | cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:1123456/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:1175210/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:1503407/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:1565581/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:1755838/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:1765522/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:1969936/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:2342706/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:2355691/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:2491541/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:2809593/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:2820438/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:3068260/62‑1 (MQ=255) cTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCgtggt  <  1:56830/62‑1 (MQ=255)                                                              | CTGAATGCGATTCCGGAAGTGGTGACCAATGGTCTGAATATCGCCGGTGGCATGATCGTGGT  >  minE/1207508‑1207569

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑