Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1216950	1216992	43	39 [0]	[0] 36	prc	carboxy‑terminal protease for penicillin‑binding protein 3

CTCTTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGA  >  minE/1216888‑1216949                                                              | ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:3281281/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:263354/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2690967/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2721465/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2748217/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:300126/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:304359/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:3110420/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:3111810/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:3211824/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2486826/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:33821/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:402038/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:530343/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:541983/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:568187/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:57291/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:709442/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:759120/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:973670/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1885956/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:109880/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1140488/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1154234/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1183363/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1360813/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1566169/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1650234/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1808077/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1871757/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1081295/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:191163/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:1994282/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2008128/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2115833/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2196178/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2237535/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2261300/1‑62 (MQ=255) ctctTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGa  >  1:2377461/1‑62 (MQ=255)                                                              | CTCTTTCTCACGCACAGCGTAATTCAGAGAAACGATATTGCGCTTGTCCTTCATAGCGTTGA  >  minE/1216888‑1216949

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑