Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1218319	1218323	5	12 [0]	[0] 48	prc	carboxy‑terminal protease for penicillin‑binding protein 3

TCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATC  >  minE/1218257‑1218318                                                              | tCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:1362299/62‑1 (MQ=255) tCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:1497987/62‑1 (MQ=255) tCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:19101/62‑1 (MQ=255) tCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:40298/62‑1 (MQ=255) tCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:974084/62‑1 (MQ=255) tCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:985059/62‑1 (MQ=255) tCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCGGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:436983/62‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:122861/61‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:2086309/61‑1 (MQ=255)  cGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:335431/61‑1 (MQ=255)          ggCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:2402650/53‑1 (MQ=255)            ccAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATc  <  1:2701753/51‑1 (MQ=255)                                                              | TCGTTTTTCGGCCAGGGCGCTTTGCTGCGGTCAAGGTTATAAGTGTCGTTGCCGGTGAAATC  >  minE/1218257‑1218318

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑