Missing coverage evidence...
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TATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTT  >  minE/92359‑92420                                                              | tATCTTCATTCGTGCTGTTGACTGCAGTCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:470902/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:3274157/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2452595/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2728385/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2846767/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2953630/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:3045271/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:32174/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:3230281/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:3271019/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2372975/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:573455/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:574439/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:766278/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:815850/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:817454/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:837141/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:923703/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1701305/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1043324/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1044080/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1170703/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1286945/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1426699/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1524896/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1555058/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1572062/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1021140/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1745424/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:1990042/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2155758/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2184820/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:220870/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2282792/62‑1 (MQ=255) tATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGttt  <  1:2292784/62‑1 (MQ=255)                                                              | TATCTTCATTCGTGCTGTGGACTGCAGGCTTTAATGATAAGATTTGTGCGCTAAATACGTTT  >  minE/92359‑92420

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑