Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1228550	1228628	79	12 [0]	[0] 11	yobA	conserved hypothetical protein

ATCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATG  >  minE/1228488‑1228549                                                              | aTCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:1361557/62‑1 (MQ=255) aTCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:1583867/62‑1 (MQ=255) aTCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:2688949/62‑1 (MQ=255) aTCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:2755178/62‑1 (MQ=255) aTCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:3258673/62‑1 (MQ=255) aTCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:3291614/62‑1 (MQ=255) aTCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:567542/62‑1 (MQ=255) aTCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:696193/62‑1 (MQ=255)  tCCAGGTAAACGCCATCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:2194276/61‑1 (MQ=255)  tCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:153111/61‑1 (MQ=255)  tCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:3255454/61‑1 (MQ=255)                        ttatttCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATg  <  1:1592109/39‑1 (MQ=255)                                                              | ATCCAGGTAAACGCCAGCATGATTTATTTCACGCTAAAGGTGTAGTGTCCTTTCGTTTTATG  >  minE/1228488‑1228549

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑