Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1280562	1280686	125	61 [0]	[0] 62	yeeJ	adhesin

TCGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCCA  >  minE/1280500‑1280561                                                              | tCGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1628028/62‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCCATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2409044/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCATTGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2357916/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAAcaca  <  1:956090/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2824210/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:3130714/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:3104037/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:3083809/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2985679/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2948286/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:294345/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2830232/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:401591/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2763127/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2708084/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2689251/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2565462/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:320813/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2416736/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:409002/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:450043/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:487468/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:601740/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:602957/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:60457/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:716196/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:731347/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:731711/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:805139/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:932283/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:961648/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:962507/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:177246/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:109489/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1206146/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1207433/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1211778/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1260342/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:130595/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:139053/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1408725/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1505499/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1590391/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1683104/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1712151/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1742748/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1743953/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1935230/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1987051/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2012822/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2061716/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2092508/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2109501/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:219574/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2224852/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:229438/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2309745/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:1052567/61‑1 (MQ=255)  cGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2480652/61‑1 (MQ=255)   gCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:2547729/60‑1 (MQ=255)   gCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCca  <  1:207818/60‑1 (MQ=255)                                                              | TCGCCAATGAGAATGCAGCAAACACCGTCTCGGTCAATGTCGCTGATGAAGGAAGCAACCCA  >  minE/1280500‑1280561

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑