Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1286978	1287005	28	5 [0]	[0] 26	shiA	shikimate transporter

ATACTAATTATAAAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACT  >  minE/1286917‑1286977                                                             | aTACTAATTATAAAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACt  <  1:1109952/61‑1 (MQ=255) aTACTAATTATAAAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACt  <  1:1200383/61‑1 (MQ=255) aTACTAATTATAAAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACt  <  1:1747435/61‑1 (MQ=255) aTACTAATTATAAAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACt  <  1:478603/61‑1 (MQ=255)  tACTAATTATAAAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACt  <  1:2012452/60‑1 (MQ=255)                                                             | ATACTAATTATAAAAAGACAGTACAAACAGGATCATTATGGACTCCACGCTCATCTCCACT  >  minE/1286917‑1286977

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑