Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1316281	1316287	7	71 [0]	[0] 19	hisF	imidazole glycerol phosphate synthase, catalytic subunit with HisF

GGCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCACC  >  minE/1316226‑1316280                                                       | ggCAAAACGCTACGCTGAAGAATGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1810373/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTTACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2499544/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGATCTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1937773/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2670388/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:295212/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2922489/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2759365/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2724280/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2692939/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2683967/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2674649/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:3034629/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2657507/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2614895/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2565933/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2499085/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2492757/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2469282/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:44764/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:803043/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:742983/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:588664/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:580809/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:577398/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:542632/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:493448/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:456014/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2466206/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:395541/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:347712/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:3290283/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:3275331/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:3235078/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:3233319/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:3215290/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:319609/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1450335/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1677375/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1645735/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1624244/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1606198/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1602006/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1553950/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1545521/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1518513/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1712898/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1412995/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1410931/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1366345/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1323793/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1306837/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:124300/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1082176/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1890674/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2346692/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2306179/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2171518/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2127778/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:2026465/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1956957/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1903050/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1899990/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:104558/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1881038/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1880673/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1868261/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1832842/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:1727401/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGCGTTCTACGATATCAcc  <  1:1758425/55‑1 (MQ=255) ggCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCAGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:295477/55‑1 (MQ=255)        cgctacgctGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCAcc  <  1:388852/48‑1 (MQ=255)                                                       | GGCAAAACGCTACGCTGAAGAAGGCGCTGACGAACTGGTGTTCTACGATATCACC  >  minE/1316226‑1316280

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑