Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1338958	1338961	4	55 [0]	[0] 3	wcaD	predicted colanic acid polymerase

TGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGT  >  minE/1338907‑1338957                                                   | tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:299273/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1046185/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2408372/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2412037/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2430738/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2437264/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2537675/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2541380/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2576249/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2615650/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2696708/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2713088/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2880968/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2918392/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2389799/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:3022198/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:3150920/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:3214915/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:414227/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:496631/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:499161/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:546993/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:602059/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:753680/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:757940/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:767675/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:787050/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:16092/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1047081/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1113231/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1125937/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1164974/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1172299/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1178323/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1315636/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1419661/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1493533/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1536552/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1547476/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1561186/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2383452/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1627781/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1673128/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1786725/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:184190/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:185593/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1915581/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:1989165/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2218226/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:230702/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2362439/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCAGGt  >  1:681200/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAAAGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2427684/1‑51 (MQ=255) tGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATAAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:2087290/1‑51 (MQ=255) tGTATGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGt  >  1:178056/1‑51 (MQ=255)                                                   | TGTTTGATGCTGAGCCAAATTGAGATTAATGCCAGAGCGAAAAATGCCGGT  >  minE/1338907‑1338957

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑