Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1360761	1360768	8	85 [0]	[0] 11	yehE	hypothetical protein

TTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGC  >  minE/1360707‑1360760                                                      | ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2512663/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2943123/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2929053/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2875399/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2848886/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2808482/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2796122/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2785383/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2759217/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2641729/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2605990/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2976241/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2456451/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2439087/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2427790/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2423234/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2417439/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2357970/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2322555/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2320307/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2299305/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:639824/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:982918/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:931464/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:891963/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:872394/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:86401/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:811327/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:786577/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:739367/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:702646/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:69398/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2253552/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:529353/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:524562/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:520707/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:376457/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:3282492/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:3254723/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:32175/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:3014363/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2986376/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1362259/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1047986/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1489191/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1454822/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1439540/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:143600/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:142972/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1417715/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1409541/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1401275/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1373496/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1547021/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1360896/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:13600/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1313199/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1298846/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1232488/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1220381/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1183723/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:114529/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1088266/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:184944/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2240340/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2198128/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:217186/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2149301/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2148948/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2127353/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2093619/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:2045291/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1879502/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1550014/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1766079/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:175094/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1739888/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1727480/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1703218/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1702977/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1684211/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1654002/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:1642697/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTAGACGTTTGc  >  1:1483067/1‑54 (MQ=255) ttAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGT‑‑CGATTTAACACGATTCGACGTTTGc  >  1:834993/1‑52 (MQ=255)                                                      | TTAAAATCAGGTTGCCAAATTAATCGTAGCGATTTAACACGATTCGACGTTTGC  >  minE/1360707‑1360760

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑