Missing coverage evidence...
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GCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAG  >  minE/105618‑105656                                       | gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2809079/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:788322/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:65434/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:651610/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:544180/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:436195/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:422125/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:3167579/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:3167101/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:3147193/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2984162/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2910118/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2903527/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2841978/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:1311206/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2802915/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2766791/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2536921/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:2207236/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:1854647/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:1846031/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:1446180/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:1436952/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:1436348/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:1356464/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACgag  >  1:1348690/1‑39 (MQ=255) gctgcGGTGATCCCCACCAGTTCAAGACCACCGAACgag  >  1:2772152/1‑39 (MQ=255)                                       | GCTGCGGTGATCCCCACCAGTTCCAGACCACCGAACGAG  >  minE/105618‑105656

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑