Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 109232 109241 10 90 [0] [0] 82 aceE pyruvate dehydrogenase, decarboxylase component E1, thiamin‑binding

CTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAAGA  >  minE/109176‑109231
                                                       |
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2809592/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:322040/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:3217590/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:3130428/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:3123175/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:303437/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2984262/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2876592/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:286916/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2823172/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2821273/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2820137/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:3229022/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2747134/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2738963/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2725248/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:265461/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2598979/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:259585/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2557236/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2510642/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2480492/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2407515/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:675992/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:998317/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:967772/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:946372/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:92594/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:873295/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:843876/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:744203/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:717500/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:715063/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:685827/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2318836/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:634765/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:634522/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:614694/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:601881/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:556665/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:511218/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:452522/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:3280008/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:3278407/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:3262894/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1204852/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1563381/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1527869/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1483655/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1476016/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1475917/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1473052/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1433165/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1379722/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1327983/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1323880/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1208350/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1643882/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1187546/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1182025/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1181922/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1113449/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1106554/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1105452/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1067409/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1027610/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1015319/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1014620/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2056892/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2312737/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2275582/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2269172/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2261608/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2255442/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2238575/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2187361/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2181160/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2127805/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2075655/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1005407/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2044121/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:2000997/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1956536/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1924618/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1902595/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1883959/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1864965/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1764600/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1720892/1‑56 (MQ=255)
cTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAaga  >  1:1689590/1‑56 (MQ=255)
                                                       |
CTTGAGCTGCCGAGCCTGCAAGACTTCGGCGCGCTGTTGGAAGAGCAGAGCAAAGA  >  minE/109176‑109231

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: