Missing coverage evidence...
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*	*	÷	minE	1441823	1441858	36	33 [0]	[0] 92	rcsD	phosphotransfer intermediate protein in two‑component regulatory system with RcsBC

CGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAT  >  minE/1441761‑1441822                                                              | cgtgTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2130306/59‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2727975/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:976914/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:951647/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:885263/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:756704/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:565093/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:3215355/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:3136168/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:3067926/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:3048839/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2965163/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2923209/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2906303/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2869536/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2830536/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1769396/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1294658/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1300975/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1328816/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1444300/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1616434/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1229166/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1892458/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2158045/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2311826/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2359999/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2614500/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:2639804/62‑1 (MQ=255) cGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGACTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:770826/62‑1 (MQ=255)  gggTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:258353/61‑1 (MQ=255)              ggACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:1521972/49‑1 (MQ=255)                   gTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAt  <  1:3211581/44‑1 (MQ=255)                                                              | CGGGTATGCCGCTGGACAGTTTCCGCCTTGAGCCAGACGCGACGGCAACGGGAAACAATGAT  >  minE/1441761‑1441822

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑