Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1444621	1444643	23	36 [0]	[0] 44	rcsC	hybrid sensory kinase in two‑component regulatory system with RcsB and YojN

GCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGT  >  minE/1444559‑1444620                                                              | gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATATCGt  <  1:2722266/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:321656/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2779480/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2787190/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2907273/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:3056028/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:3075701/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:3106424/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:3180186/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:947224/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:3280759/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:379558/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:391972/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:442514/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:650218/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:721466/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:919950/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1131671/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2552885/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1202044/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1263120/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1268962/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1284463/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1397500/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2061447/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2149062/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:227919/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2282282/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2297004/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:243459/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:2662287/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGACATATAACGt  <  1:1485141/62‑1 (MQ=255) gcgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTACTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1947870/62‑1 (MQ=255)  cgTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:517903/61‑1 (MQ=255)    tAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1556707/59‑1 (MQ=255)            ttATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGt  <  1:1295289/51‑1 (MQ=255)                                                              | GCGTAAACGCCTTATCCGTCCTACGAATCCCGCGATTTCCTGACCCTCTCGGCATATAACGT  >  minE/1444559‑1444620

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑