Missing coverage evidence...
   seq id start end size ←reads reads→ gene description
* * ÷ minE 1450619 1450636 18 34 [0] [0] 70 atoC fused response regulator of ato opeon, in two‑component system with AtoS

CATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAA  >  minE/1450557‑1450618
                                                             |
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cATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:462086/62‑1 (MQ=255)
cATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:338195/62‑1 (MQ=255)
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cATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:3144537/62‑1 (MQ=255)
cATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:3140944/62‑1 (MQ=255)
cATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:3061354/62‑1 (MQ=255)
cATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:3053881/62‑1 (MQ=255)
cATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:2764741/62‑1 (MQ=255)
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               tCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:843733/47‑1 (MQ=255)
                        acaGATTCGTCAGCCAGGCTGTAATGCTGGCGAGGTaa  <  1:2904589/38‑1 (MQ=255)
                                                             |
CATTTTTTCTGAGGATCTTCCGCCACAGATTCGTCAGCCAGTCTGTAATGCTGGCGAGGTAA  >  minE/1450557‑1450618

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap:     Deleted base: