Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1462724	1462732	9	95 [0]	[0] 5	yfaA	hypothetical protein

TCGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGATATA  >  minE/1462663‑1462723                                                             | tcGGCAGACTGGTCTACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1729791/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCTGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:19367/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2775855/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:480826/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:470770/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:445683/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:435817/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:3164035/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:3091086/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2957332/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2911508/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2832458/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:512050/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2774334/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2750467/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:272867/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2660306/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2658571/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2658433/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2658192/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2626415/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2612451/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2601311/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1037013/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:788197/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:992559/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:991017/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:976446/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:972636/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:957561/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:948795/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:948154/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:921329/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:914573/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:903590/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:793489/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2528050/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:737971/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:64915/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:639284/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:59602/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:577203/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:562485/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:558633/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:557480/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:534253/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:530706/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1434602/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1765927/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2448525/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1699844/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1688785/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1674128/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1637651/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1564149/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:152888/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1522556/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1498240/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:148461/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1723097/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:141941/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1408733/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1404144/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1386533/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:131671/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1263781/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1151781/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1130322/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1113612/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1055882/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1937783/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2287860/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2246303/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2218968/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2132856/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1829737/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2305994/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2317213/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2353517/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2395153/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1920855/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1864156/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2405386/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1835002/61‑1 (MQ=255) tcGGCAGACAGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:3127723/61‑1 (MQ=255)  cGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2816520/60‑1 (MQ=255)  cGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2715810/60‑1 (MQ=255)  cGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2874742/60‑1 (MQ=255)  cGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1535868/60‑1 (MQ=255)  cGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1616933/60‑1 (MQ=255)  cGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:162698/60‑1 (MQ=255)  cGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1856095/60‑1 (MQ=255)   ggCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:2446221/59‑1 (MQ=255)     cAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:236692/57‑1 (MQ=255)                aCGTTTCGTTACGCAGCTGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGAtata  <  1:1956236/46‑1 (MQ=255)                                                             | TCGGCAGACTGGTCAACGTTTCGTTACGCAGCAGTTTCGCTATTCCTTGTGGATTGATATA  >  minE/1462663‑1462723

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑