Missing coverage evidence...
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TGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTCC  >  minE/1527017‑1527078                                                              | tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:3209059/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2319000/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2511765/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2622887/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2727518/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2836526/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2965632/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:301357/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:3049110/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:114482/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:536351/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:542595/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:607937/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:649726/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:705276/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:743779/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:918738/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1713223/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1044317/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1165209/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1199927/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1214654/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1341911/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1358018/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1390526/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2295311/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1739722/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2006569/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2102273/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2109153/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2144674/62‑1 (MQ=255) tGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2234737/62‑1 (MQ=255)  gAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1881097/61‑1 (MQ=255)  gAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2419447/61‑1 (MQ=255)  gAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:797920/61‑1 (MQ=255)  gAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:810667/61‑1 (MQ=255)      cacTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:1668874/57‑1 (MQ=255)         ttctCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTcc  <  1:2962938/52‑1 (MQ=255)                                                              | TGAAACACTACTCCATACAACCTGCCAACCTCGAATTTAATGCTGAGGGTACACCTGTTTCC  >  minE/1527017‑1527078

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑