Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1629221	1629238	18	67 [0]	[0] 31	yffH	predicted NUDIX hydrolase

ATTGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCT  >  minE/1629160‑1629220                                                             | attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTTCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:31403/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2758549/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:3177214/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:3110987/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2932540/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2920139/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2913922/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:290839/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2766397/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:3191170/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2713209/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2711675/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2634248/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2603950/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2600287/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2584580/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2498736/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:424536/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:923371/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:852087/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:740602/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:72859/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:672600/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:636864/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:513443/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:445923/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2441649/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:408182/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:355483/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:3284534/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:3282185/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:3266335/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:3244913/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:3210130/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1365635/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1640193/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1520060/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1518135/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1485026/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1437571/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1421388/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1409776/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1371625/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:165759/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1295026/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1257842/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1253503/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:123016/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:122278/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1213737/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1144990/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1048173/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1672489/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1694169/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1700204/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1786817/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1829930/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1839845/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1847302/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:1978549/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2048220/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2052054/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2270165/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2270768/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2286071/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2398901/61‑1 (MQ=255) attGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCt  <  1:2409088/61‑1 (MQ=255)                                                             | ATTGTTATTTTTCAGTCCATTAAATGTGACGTTTGCAAATAGTTAAGCAATAACACCGTCT  >  minE/1629160‑1629220

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑