Missing coverage evidence...
			seq id	start	end	size	←reads	reads→	gene	description
*	*	÷	minE	1635646	1635665	20	35 [0]	[0] 28	acrD	aminoglycoside/multidrug efflux system

GCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCGAGA  >  minE/1635593‑1635645                                                     | gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGTGCAAATCgaga  >  1:2893696/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCATATCgaga  >  1:23599/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:371882/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2691226/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2713206/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:3126354/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:3192947/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:3203427/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:3285735/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2622721/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:385836/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:388119/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:403600/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:452625/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:499551/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:607285/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:986379/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:995347/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1867374/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1235790/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1376738/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1393770/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1428474/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1458272/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1615629/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1640498/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1765503/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1898102/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2082880/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2084959/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2274282/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2382676/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2613320/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:1129925/1‑53 (MQ=255) gCCCAGCGGTTCAAAGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCgaga  >  1:2670337/1‑53 (MQ=255)                                                     | GCCCAGCGGTTCAACGCAACAACAGACCCTGAAAGTCGTTGAGCAAATCGAGA  >  minE/1635593‑1635645

Alignment Legend
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG
Unaligned base: atcg    Masked matching base: atcg    Alignment gap: ‑    Deleted base: ‑